真核生物转录组测序的研究对象为特定组织或细胞在某一功能状态下所能转录出来的RNA的总和，主要包括 mRNA、 LncRNA和环状RNA。常规的转录组分析仅通过Oligo(dT)法对mRNA进行富集和分析，会导致包括环状RNA和相当比例的LncRNA丢失，无法准确，反映真实的转录组信息。津科生物转录组测序服务采用样品预处理和建库方案，能够同时检测样品中的mRNA、LncRNA和环状RNA，获取转录组信息，进而针对不同类型的RNA进行表达分析，结构研究，变异研究以及全新转录本的发现。

津科优势

（1）检测全部类型的RNA

常规的转录组测序采用Oligo d(T)法纯化带Poly(A)尾巴的RNA分子。然而很多热门的RNA分子，如环状RNA和部分LncRNA，没有Poly(A)尾巴，因此在处理过程中会被丢失掉。津科生物拥有市面上针对不同物种的去rRNA试剂盒，能够保留全部类型的RNA信息。

（2）适用于降解样品

津科生物采用特有的，可适用于降解样品的试剂盒，能够极大程度的保留降解样品中的RNA信息。尤其适合于临床样品的转录组检测。

（3）链特异性检测

很多基因位点会生成转录方向相反的、具有重要调控功能的反义RNA。常规的建库方法无法区分这些反义RNA，而津科生物采用链特异性的建库方法，可以准确检测反义RNA，从而提供更全面的转录组信息。

（4）一站式服务

客户只需提供细胞，组织，体液或总RNA，津科生物为您完成从样品准备，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。

（5）专业化的生物信息分析

津科生物具有强大的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析要求。

样本要求

（1）样品类型

组织、细胞、体液、总RNA。其它类型样品请详询。

（2）样品量

a) 细胞：2×107

b) 组织：100 mg

c) 体液：全血、血清、血浆2-3 ml

脑脊液：5 ml

尿液：50 ml

d) 总RNA：2 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5; 无明显降解，电泳检测样品特征性条带完整清晰，无明显弥散或拖尾)

（3）样品运输及保存：

样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。

样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存;血液样品应使用EDTA抗凝，不可用肝素;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。

数据分析（下列有※表示个性化分析）

1、差异表达mRNA/环状RNA/LncRNA筛选

根据高通量测序结果，筛选出(Fold Change≥2，P值≤ 0.05)差异表达mRNA/环状RNA/LncRNA。

注：Fold Change代表差异程度，P值代表差异的明显性，筛选中采用的倍数变化会根据具体数据情况进行调整。

2、差异表达mRNA/环状RNA/LncRNA的聚类

3、差异表达mRNA/环状RNA/LncRNA的GO和信号通路分析

对差异mRNA/环状RNA/LncRNA的来源基因进行功能和信号通路富集分析，以便推断mRNA/环状RNA/LncRNA的功能。

4、LncRNA-mRNA共表达网络(CNC网络)构建※

利用LncRNA与mRNA的共表达关系，构建LncRNA-mRNA共表达网络图，帮助发现LncRNA的靶基因，并推断LncRNA的功能。

5、竞争性内源RNA(ceRNA)分析※

通过circRNA-miRNA相互作用网络分析，可以帮助解析作为miRNA海绵发挥作用的环状RNA的功能以及作用机制。

6、circRNA/LncRNA-miRNA-mRNA网络构建※

一些circRNA/LncRNA可以通过与miRNA结合，调节miRNA靶基因的表达。通过circRNA/LncRNA-miRNA-mRNA关联分析，可以帮助推断作为miRNA海绵发挥作用的circRNA/LncRNA以及作用机制。

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